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处级机构
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纪委(监察室)
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组织部(人事处)
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西藏藏医学院附属医院
直属科级机构
学院财务科、 图书与信息网络中心
藏医药与天文星算博物馆、实验标本中心
西藏藏医学院藏药厂
群团组织
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教育工会(办公室负责和管理)
团委(学工处负责和管理)
学院妇委会(人事处负责和管理)